胰腺癌基因的微陣列分析


2.64萬字 64頁 包括外文翻譯，原創(chuàng)作品，通過查重系統(tǒng)

摘 要
胰腺癌是一種相當棘手的人類癌癥，這很大程度上是因為其病情進展迅速且診斷困難，目前用于其診斷的有效的分子標志物尚少發(fā)現(xiàn)。隨著人類基因組計劃的發(fā)展，生物信息學在人類疾病相關基因的鑒別、基因與蛋白質的表達與功能研究等方面都發(fā)揮著重要的作用。尤其在疾病診斷領域，生物基因芯片通過對全組基因表達圖譜進行數(shù)據(jù)挖掘，可以成功地將臨床表征不明或容易誤診的腫瘤準確、快速地區(qū)分開，從而為癌癥的早期診斷與及時治療做出了突出的貢獻?；蛭㈥嚵屑夹g給發(fā)現(xiàn)癌癥早期診斷的分子標志物提供了強大的工具，它能夠在同一個水平上面對大量的基因進行檢測和分析。
胰腺癌中85%的患者是胰腺導管癌，本文便從對胰腺導管癌的基因表達進行分析下手，應用了微陣列分析方法，希望從大量的基因微陣列數(shù)據(jù)中發(fā)現(xiàn)胰腺癌的潛在分子標志物。我們在實驗中對一個含有49個樣本的微陣列數(shù)據(jù)矩陣(其中24個是胰腺導管癌患者，另外25個為正常樣本)應用了兩種方法進行分析。首先對樣本應用了方差分析法，篩選出來21個具有表達差異的數(shù)據(jù)集，其對應的基因可能作為潛在的標志基因；由于其3-D散點圖表明在這個結果中癌癥和正常細胞之間并不能完全實現(xiàn)精準的區(qū)分，因此我又采用了一種有監(jiān)督的預測算法—WV算法（weighted vote method，WV），在確定五個基因為訓練集對樣本進行預測分析時，預測精準度能達到81.6%，通過這個方法我們得到了11個具有表達差異的數(shù)據(jù)集。通過兩個方法的共同分析，以及對得到的可能的標志基因進行功能查詢，我們最終確定了EPPK1 、SCGB3A1、PLOD2和DKFZp564I1922這四個基因的表達值變化以及其調控的蛋白質在細胞中表達作為潛在的分子標志物，有希望用于胰腺癌的早期診斷。
我們的研究為尋找胰腺癌的分子標志物提供了一個新的思路，盡管對于篩選的潛在標志物仍需進行大量的生物驗證實驗，但不難發(fā)現(xiàn)微陣列技術應用于癌癥診斷的潛在的分子標志物的篩選和尋找有很大的作用。


關鍵詞：生物信息學；DNA微陣列技術；雙向聚類；方差分析；監(jiān)督算法