苜蓿切葉蜂bHLH轉(zhuǎn)錄因子家族成員鑒定

1萬字 27頁 原創(chuàng)作品，已通過查重系統(tǒng)

摘 要
bHLH 轉(zhuǎn)錄因子在真核生物生長發(fā)育調(diào)控中具有重要作用 它們組成了轉(zhuǎn)錄因子的一個大家族。已經(jīng)有20種生物基因組中bHLH家族的成員得到鑒定 其中動物17種、植物2種、酵母1種。動物bHLH因其調(diào)控基因表達的功能不同而被分成45個家族 分別參與調(diào)控神經(jīng)元發(fā)生、肌細胞生成、腸組織發(fā)育以及環(huán)境毒素響應(yīng)等生物學(xué)過程。
苜蓿切葉蜂(Megachile rotundata)基因組測序已經(jīng)完成，而其bHLH家族成員尚未得到鑒定。本研究對苜蓿切葉蜂基因組中bHLH基因家族成員進行了分析。通過用已知的45條bHLH轉(zhuǎn)錄因子的蛋白質(zhì)序列在苜蓿切葉蜂基因組內(nèi)進行tBlastn搜索，在苜蓿切葉蜂基因組中找到了42個bHLH蛋白的編碼基因；通過構(gòu)建進化樹，找出了與這42個苜蓿切葉蜂bHLH基因在果蠅中的同源基因。此外，在苜蓿切葉蜂基因組中沒有發(fā)現(xiàn)編碼SREBP、ARNT、BMAL、Hey、Max、COE家族bHLH蛋白的基因。這些結(jié)果的取得為進一步開展苜蓿切葉蜂bHLH蛋白結(jié)構(gòu)與功能研究打下了良好基礎(chǔ)。

關(guān)鍵詞：苜蓿切葉蜂(Megachile rotundata)，bHLH轉(zhuǎn)錄因子，blast搜索，內(nèi)含子，進化樹 多序列比對。