農(nóng)產(chǎn)品收購加工行業(yè)作為鏈接國民經(jīng)濟(jì)一、二產(chǎn)業(yè)的中間環(huán)節(jié)，對促進(jìn)農(nóng)產(chǎn)品流通，增加農(nóng)民收入，保障國民經(jīng)濟(jì)正常運行都起著不可估量的重要作用。新中國成立以來，無論是建國初期遏制惡性通貨膨脹，迅速恢復(fù)國民經(jīng)濟(jì)，還是社會主義經(jīng)濟(jì)建設(shè)探索時期，每當(dāng)國民經(jīng)濟(jì)出現(xiàn)困難進(jìn)行宏觀調(diào)控時，無一不是把農(nóng)產(chǎn)品流通環(huán)節(jié)作為突破口之一，因此確保農(nóng)產(chǎn)品流通順暢，成為國家宏觀調(diào)控、制定經(jīng)濟(jì)政策的一項原則?；诖耍孓r(nóng)稅收政策的制定以寧寬勿嚴(yán)為指導(dǎo)，出臺了大量稅收優(yōu)惠政策，如對農(nóng)業(yè)生產(chǎn)者銷售自產(chǎn)農(nóng)產(chǎn)品、批發(fā)零售農(nóng)業(yè)生產(chǎn)資料、向農(nóng)業(yè)生產(chǎn)提供的服務(wù)等免征增值稅、營業(yè)稅，增值稅一般納稅人向農(nóng)民購進(jìn)的農(nóng)產(chǎn)品時，可按照自行開具收購發(fā)票的金額計算抵扣進(jìn)項稅額，向小規(guī)模納稅人購進(jìn)農(nóng)產(chǎn)品可按取得的普通發(fā)票金額計算抵扣進(jìn)項稅額，從2002年起進(jìn)項稅計提比例也由10%提高到13%等。農(nóng)副產(chǎn)品收購稅收政策的出臺，在一定程度上解決了一些以農(nóng)產(chǎn)品為主要原料加工、生產(chǎn)企業(yè)的進(jìn)項稅抵扣問題，為企業(yè)公平稅負(fù)、公平競爭創(chuàng)造了良好的稅收環(huán)境。但由于納稅人使用收購發(fā)票的過程中是自開自抵，稅務(wù)機關(guān)在審核進(jìn)項稅額的合理性和真實性時，缺乏有效的比對數(shù)據(jù)，同時，農(nóng)產(chǎn)品收購發(fā)票也是增值稅其他抵扣憑證中唯一沒有也是無法納入信息化監(jiān)控的重要票據(jù)。于是，收購農(nóng)產(chǎn)品的納稅人（以下簡稱農(nóng)產(chǎn)品企業(yè)）受利益驅(qū)動，虛開、代開、擅自擴大農(nóng)產(chǎn)品收購發(fā)票的開具范圍，虛開虛抵，成為偷騙稅行為發(fā)生的重災(zāi)區(qū)，由于政策原因，形成加工企業(yè)低稅負(fù)、負(fù)稅負(fù)，進(jìn)而成為虛開增值稅專用發(fā)票從事不法行為的源頭；稅務(wù)部門則缺乏有效措施對其進(jìn)行約束，潛在稅收執(zhí)法風(fēng)險十分巨大。因此必須出臺一套更加科學(xué)合理的農(nóng)副產(chǎn)品行業(yè)的稅收政策，這套稅收政策即要能更好的預(yù)防稅收風(fēng)險，有要能處進(jìn)國民經(jīng)濟(jì)健康發(fā)展。