東方大黃蜂bHLH轉(zhuǎn)錄因子家族成員鑒定

1.17萬(wàn)字 32頁(yè) 原創(chuàng)作品，已通過(guò)查重系統(tǒng)

摘 要
堿性螺旋-環(huán)-螺旋（basic helix-loop-helix，bHLH）基因家族是一類具有轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)因子的家族，通過(guò)研究可以了解到該家族在生物各個(gè)生長(zhǎng)發(fā)育調(diào)控過(guò)程中都會(huì)起到重要的調(diào)控作用，并且它們也是構(gòu)成了真核生物蛋白質(zhì)中的一個(gè)偌大的家族（bHLH轉(zhuǎn)錄因子家族）。如今東方大黃蜂(Bombus impatiens)的基因組測(cè)序工作已經(jīng)順利的完成，但是它的bHLH家族中的各個(gè)成員還未能獲得鑒定。因此我們開展了東方大黃蜂bHLH轉(zhuǎn)錄因子家族成員的鑒定工作，此項(xiàng)工作不僅可以為進(jìn)一步研究不同生物bHLH基因的進(jìn)化關(guān)系、為進(jìn)一步了解整個(gè)bHLH大家族的進(jìn)化歷史提供非常大的幫助而且也為物種演化歷史提供有關(guān)相應(yīng)的線索。
本次研究是采用生物信息學(xué)的相關(guān)方法對(duì)東方大黃蜂bHLH轉(zhuǎn)錄因子家族成員進(jìn)行科學(xué)探索，目的就是鑒定出東方大黃蜂中bHLH轉(zhuǎn)錄因子成員的數(shù)目，判斷出東方大黃蜂bHLH轉(zhuǎn)錄因子成員分別屬于哪些家族。通過(guò)研究我從東方大黃蜂基因組中鑒定出了39個(gè)bHLH轉(zhuǎn)錄因子編碼區(qū)；并且與59個(gè)果蠅bHLH基序做了相應(yīng)的系統(tǒng)發(fā)生分析，隨后又將39個(gè)東方大黃蜂bHLH成員劃分到了其歸屬的bHLH家族中 ；結(jié)果發(fā)現(xiàn)東方大黃蜂基因組中沒(méi)有Hand、Mnt、AP4、SCL、NSCL和MITF家族bHLH蛋白的編碼區(qū)域?？梢哉f(shuō)該研究所獲得的結(jié)果不僅為今后開展有關(guān)東方大黃蜂生長(zhǎng)發(fā)育調(diào)控機(jī)理方面的各項(xiàng)研究工作積累了豐富的基礎(chǔ)資料，也為進(jìn)一步開展相關(guān)基因的表達(dá)譜分析打下了良好而又堅(jiān)實(shí)的基礎(chǔ)；同時(shí)該研究也為進(jìn)一步深入分析東方大黃蜂bHLH蛋白的結(jié)構(gòu)提供了不可或缺的背景資料。


關(guān)鍵詞：東方大黃蜂;基因組;bHLH;轉(zhuǎn)錄因子;系統(tǒng)進(jìn)化分析